2023年度 PAGS・DDBJ合同 中級者情報解析講習会のご案内
「先進ゲノム支援」では支援活動の一環として情報解析講習会を開催しています。今年度第 2 回目となる今回は、中級者向けです。プログラミング言語「Python」を用いた塩基配列データの扱いや多変量解析等のプログラミング実習を中心に、以下の要領で開催いたします。
本講習会は、先進ゲノム支援(PAGS)、生命情報・DDBJ センター(DDBJ)が合同で開催いたします。
■詳細:
■日 時:
1 日目:2024 年 2 月 13 日(火)12:10 ~ 18:00
2 日目:2024 年 2 月 14 日(水) 9:20 ~ 18:00
■会 場:
Zoom ウェビナー ※現地開催はございません。
■講習内容:
プログラミング言語「Python」を用いた塩基配列データの扱いや多変量解析等のプログラミング実習を中心に実施。
■想定スキルレベル:
情報解析中級者
■定員:
200 名
- これから自分で実践的にバイオインフォマティクス関連のプログラミングをしようと考えている方。
- 基本的なLinux コマンドや Python 言語の知識を身につけていることを前提とします。
- 応募者多数の場合は、先進ゲノム支援における支援依頼者を優先します。
- 各自のPC をご用意ください(memory 8GB 以上、空きHDD 容量 30GB 以上あれば、Windows10/11、Mac、Linux いずれも可)。
- 講習では Jupyter notebook を用いて Python の講習を行います。
- 事前に必要なソフトウェア (Python のモジュール) を各自のPC にインストールしていただく必要があります。
■参加費用:
無料
■受講者が講習当日までに準備すべき項目
(インストールが必要な Python モジュールについては後日別途アナウンスいたします):
■講習会スケジュール(予定):
【2 月 13 日:1 日目】
12:10~12:20 |
講習会説明 |
12:20~13:50 |
文字列処理、ファイルの読み書き、正規表現 |
14:00~15:30 |
Jupyter notebook、Biopython を用いた処理 15:40~16:10 Numpy |
16:10~17:00 |
表形式ファイルの処理(Pandas) |
17:00~18:00 |
質疑応答 |
【2 月 14 日:2 日目】
9:20~10:50 |
視覚化 (matplotlib, seaborn) |
11:00~12:30 |
統計的仮説検定 |
12:30~13:20 |
昼食休憩 |
13:20~14:50 |
Python を用いたシングルセル RNA-seq 解析(基礎) |
15:00~17:00 |
Python を用いたシングルセル RNA-seq 解析(発展) |
17:00~18:00 |
質疑応答 |
■申し込み〆切:
2024 年 2 月 2 日(金)
■申し込み方法: